在获利能力、商品周转速度方面，两者存在着明显差额。一般而言，独立零售商虽然拥有较大的灵活性、较低的投资以及对商店经营策略、形象、格式的完全控制，拥有独立经营和受创业精神驱动的优势，但其所存在的一系列劣势也非常明显：有限的讨价还价能力，较小的规模和较密集的劳动力，难于利用媒体，过分依赖老板以及缺乏用于规划的时间和资源。由于独立零售商每次进货数量很小，因此缺乏与供应商讨价还价的能力，往往要以较高的价格进货。独立零售商通常难以建立规模经济，在商品的采购和存货管理方面要支出较高的交通运输成本、订购和理货成本。独立零售商通常劳动力较为密集，在订货、存货管理、商品标价、销售统计、会计方面主要以人力劳动为主，较计算机操作更浪费时间和低效。大多数的独立零售商店主和经理合一，有创业积极性，但多以小的、家庭经营为主而过分依赖店主，几乎所有的决策均由店主一人做出。如果老板病了，或在度假或退休了，管理的一致性、连续性就会受到影响。对独立零售商而言，还有一个不容忽视的缺点就是独立零售商用于长期规划的时间和资源的数量相当有限，因为老板紧密参与商店的日常营业活动对商店长期发展的事务也就无暇顾及了。虽然独立零售商在选择商店区位、开发营业策略方面享有灵活性，单店投资相对较低，熟悉本区域的消费者情况，以友善、个性化的形象为消费者服务，但其一系列劣势决定了独立零售商处于不利地位，难以和大零售连锁商竞争。连锁商常拥有下列优势：议价能力、批发效率、多店铺效率、计算机使用、利用媒体传播广告、明确的管理和长期规划。一个大连锁商在同制造商交易时具有很强的议价能力，它可以以失去业务威胁制造商，迫使制造商提供低于市场价的折扣价格。连锁店还可以通过批发功能实现成本节约。采购、运输、储存和其他批发活动均可由连锁店的职能部门执行，可以减少批发销售人员，增加订购量，连锁商购买产品的成本比独立零售商低得多。连锁店可以通过低融资成本、低租金成本，集中决策，实现多店营运的效率。通过对采购、定价和促销的决策集中化，可以从采购数量的增加、减少分店经理或专业人员的采购获取经济效益。通常连锁店相当的资源和交易数量决定了连锁店可以在商品采购、存货管理、销售预测、销售额统计、会计方面运用计算机，以提高效率，降低总成本。不管是区域性的还是全国性的连锁店，一般能够利用从电视到杂志、报纸等不同媒体，巨大的销售额和广阔的市场覆盖区域使连锁店可利用各种媒体。大多数连锁店都具有明确的管理思想，总的策略清楚，员工的职责明确。当出现管理层人事变动时，管理的一致性和连续性可以保持。大多数连锁店投入相当的时间和资源用于长期规划，有关的机会和限制因素通常会被有关专家详细研究。
与独立商相比，连锁店也有一些缺点。首先，一个已建立的连锁店缺乏灵活性，适合开店的地址难寻，一致的策略，相同的价格、促销和产品深度以及集中决策使每个分店不能根据各自的习惯、消费者特点进行调整。其次，对连锁店而言，多店铺的租金、装修、产品成本、雇员工资等，投资是相当高的。第三，多店铺的管理也较难，由于缺乏沟通和时间延误，可能使最高层的控制难以有效实施。第四，大连锁店中的个人独立性受到限制，分层管理限制了个人的独立性。这些缺点可以由管理的改善和技术的进步而逐渐克服。
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